Voorbeelden van het gebruik van Imagej in het Nederlands en hun vertalingen in het Spaans
{-}
-
Colloquial
-
Official
-
Medicine
-
Financial
-
Ecclesiastic
-
Ecclesiastic
-
Official/political
-
Computer
-
Programming
Selecteer in het menu ImageJ Pluginsgt; macro'sgt; uitvoeren….
Aggregaat beelden worden vastgelegd, gedigitaliseerd en geanalyseerd met behulp van ImageJ.
Selecteer in het menu ImageJ analyserengt; maatregel(of druk op Ctrl+ M) voor het meten van de lengte van de lijn.
CellProfiler werd uitgevonden en werd verbeterd voor hoogte, tweedimensionale beelden. IMAGEJ.
Deze beelden kunnen worden geïmporteerd in de ImageJ software voor kwantificering en analyse van de intensiteit van de pixel langs een aangewezen as.
Opmerking: Alle opdrachten die worden gebruikt om het script te schrijven,worden beschreven in de ImageJ handleiding:.
Selecteer in het menu ImageJ analyserengt; Histogram genereren(of druk op Ctrl+ H) voor het genereren van een histogram voor beeld pixel intensiteiten.
Allereerst dat de batchanalyse"Proces" dan"Batch" en uiteindelijk"Macro" te selecteren in het menu ImageJ.
Met behulp van de microarray plugin in ImageJ, werd de gemiddelde intensiteit van de rode en groene bacteriën gemeten in de gecorrigeerde beelden, samen met een lokaal achtergrondsignaal.
Indien nodig kan de foto worden aangepast met behulpvan"image"-"aanpassen"-"helderheid/ contrast" of"image"-"aanpassen"-"venster/ niveau" in ImageJ.
Zodra het videobestand wordt geopend in ImageJ, snijd de video om een constante 2 min exploratie vanaf het moment de onderzoeker de geurstoffen is gepipetteerd in de kooi(T0) te verkrijgen.
Meest geautomatiseerde imaging platformen kunnen ook wordengekoppeld aan downstream software voor beeldverwerking(bijvoorbeeld MetaMorph, ImageJ, Gene5 of cel Profiler) ter bevordering van het rendement van informatie.
Via beeldanalyse software zoals ImageJ 11 en de bijbehorende plugins, kan een lijst van fenotypen vervolgens geëxtraheerd uit de beeldgegevens met de geregistreerde annotaties van de cellen.
Een gebruiker bij de ALS faciliteit kan het hele proces vanwederopbouw uit te voeren met behulp van een aangepaste plugin voor ImageJ/ Fiji, waarin verschillende softwarepakketten ontwikkeld om het proces van wederopbouw te stroomlijnen integreert.
In ImageJ, wanneer zal de knop het slice/ totaal aantal plakjes opent wordt weergegeven in de linker bovenhoek van het venster, samen met de bestandsnaam, het aantal pixels, file type en grootte.
Opmerking: Dit gedeelte van het protocol maakt gebruik van een derde-partij PIV plug-in voor ImageJ, die berust op Gaussiaans piek-montage om een schatting van de verplaatsing met subpixel nauwkeurigheid.
Andere programma's zoals ImageJ kunnen ook worden gebruikt om de afstand te meten, maar Zeiss Zen Light heeft de voorkeur vanwege de hogere resolutie van het beeld en het gemak om in te zoomen en met behulp van dat programma.
Theoretisch experimenten kunnen uitgevoerd worden met elke software die tijdsverloop imaging maakt het mogelijk, en het beeld sequenties kunnenpost-experimenteel worden geanalyseerd met behulp van software zoals ImageJ WEB of Fiji(WEB/ fiji. sc/ Fiji).
Selecteer in het menu ImageJ Bewerkengt; duidelijk buiten sensor ruis verwijderen op locaties waar geen signaal is verwacht(bijvoorbeeldgebieden buiten de grenzen van de muur vaartuig), die de totale SNR kan verminderen.
Voor degenen die het podium posities in die cellen gaan door mitose(zoals bepaald door zowel de DNA en cellulaire morfologie), kunt u films en montages met behulp van Metamorph,of met andere programma's zoals ImageJ(gratis beschikbaar via NIH).
Indien nodig, het downloaden van Plugins in de sectie downloadengt; Input/Output voor de ImageJ website te openen het afbeeldingsbestand gegenereerd, afhankelijk van het formaat van de afbeeldingen gegenereerd door de confocal microscoop.
(E) in imagej of een beeldanalyse programma wordt het oorspronkelijke traject(onderbroken lijn) gemarkeerd door een lijn die wordt getekend vanuit het midden van de cel door het midden van de voorloop rand in het eerste frame.
Beelden van de volledige thoraces werden genomen op 10 X en spier gebied werd gekwantificeerd door de binarizing van beelden(van gelijke afmetingen) en kwantificeren van percentage van pixels overeenkomt met spierweefsel(zwarte pixels)uit totaal, met ImageJ software.
Met de tijd-vervallen video-fotografie en computer software ImageJ, neutrofielen intraluminale kruipen op endotheel, neutrofiel transendotheliale migratie en de migratie en chemotaxis in het weefsel worden gevisualiseerd en bijgehouden.
Om de bruto anatomie van hersenvaten, beelden van het dorsale oppervlak van de hersenen ofwel gekleurd met gekleurde latex ofCB1+ CB2 inkten kunnen worden geanalyseerd met ImageJ software(een op Java gebaseerde publieke domein software die wordt gebruikt voor beeldverwerking en-analyse) te analyseren.
ImageJ zullen produceren een grote tabel met de ruimte van alle pixels binnen het bereik van de intensiteit drempel, en de gemiddelde, mediaan, minimale en maximale(limiet) intensiteit waarde voor het gebied binnen de plafonds voor de intensiteit van drempel.
Enkele recente studies het gebruik van open source image analyse software gereedschapskisten zoalsCellProfiler 8-10 en ImageJ 11 tot rudimentaire segmentatie routines/ macro's die Correctie helderheid en eenvoudige drempeling betrokken ontwikkelen.
Selecteer in het menu ImageJ procesgt; Filtersgt; Gaussian Blur met een straal van 1,5 tot het verminderen van artefacten die voortvloeien uit de incidentele verwijdering van verlichte pixels in de buurt van een 3 x 3 door de voorafgaande despeckling werking.
Gebruik de 'CMU 1394 Camera Driver' plugin van de ImageJ software(zie de tabel van specifieke materialen voor het downloaden adressen van deze twee software stuks) om een 60 seconden video filmpje van geselecteerde immobiele protoplasten opnemen(vermoedelijk, die vast aan de onderkant) met een snelheid van 1 image/ sec(1 Hz).
ImageJ software is zeer geschikt voor het kwantificeren van cellulaire mRNA distributie, omdat het kan worden gebruikt om handmatig scheiden nucleaire en cytoplasmatische fracties, kan het meten van de gemiddelde fluorescentie van deze fracties, en de output gegevens kunnen gemakkelijk worden gekopieerd en geplakt in andere software, zoals Microsoft Excel.
