Приклади вживання Молекулярної динаміки Українська мовою та їх переклад на Англійською
{-}
-
Colloquial
-
Ecclesiastic
-
Computer
Методи Монте-Карло та молекулярної динаміки.
Amber- пакет програм для молекулярної динаміки білків і нуклеїнових кислот.
Методи Монте-Карло та молекулярної динаміки.
Зміна гiдратації при комплексоутворенні ароматичних лiгандів з ДНК: моделювання методом молекулярної динаміки.
Моделювання складних фізико-хімічних та біологічних систем за допомогою методів молекулярної динаміки, дисипативної динаміки та Монте-Карло;
Новий метод ідентификаціїієрархії доменів у білках на основі даних молекулярної динаміки.
Методом молекулярної динаміки проведено моделювання водних розчинів вуглецевих нанотрубок, функціоналізованих аніонними групами-COO- на краях.
Визначення конформаційних релаксацій сироваткового альбуміну людини методом молекулярної динаміки зі стрибками тиску.
Він використовується для забезпечення безпеки ядерної зброї тадля проведення масштабних розрахунків молекулярної динаміки.
За допомогою методу молекулярної динаміки досліджено характер гідратації протиіонів Na+, K+, Cs+ та Mg2+, що взаємодіють з подвійною спіраллю ДНК.
Дослідження впливу консервативної мутації Leu10→Ile навнутрішньомолекулярну рухливість ВІЛ-1 протеази методом молекулярної динаміки.
Віртуальний скринінг комбінаторних бібліотек з використанням програм докінгу молекулярної динаміки та моделювання за гомологією(за необхідності).
Механізм взаємодії субстратів з активним центром тирозил- тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis за даними молекулярної динаміки.
Моделювання методом молекулярної динаміки процесів формування морфології росту та структури нанокластерів металооксидів сформованих з лазерної ерозійної плазми в хімічно-активному середовищі.
Отже, функціональні форми f j{\displaystyle f_{j}} зазвичай вибираються у вигляді поліномів низького порядку або рівняння Гілла,які слугують анзацом для реальної молекулярної динаміки.
Програма має графічний інтерфейс, заснований на GTK+2 і підтримує квантово-механічні та молекулярні механічні моделі,з оптимізацією геометрії, молекулярної динаміки, а також великий набір інструментів візуалізації.
Поряд з експериментальними дослідженнями за допомогою методів комп'ютерного моделювання-методів Монте Карло та молекулярної динаміки було проведено теоретичний аналіз гідратації біологічно активних речовин, нуклеїнових кислот.
Використання методів докінгу, класичної та неемпіричної молекулярної динаміки для вивчення физико-хімічних властивостей нуклеозид-трифосфатів та їхньої правильної і неправильної взаємодії у активному центрі ДНК-полімерази.
Рецепторно-орієнтований віртуальний скринінг, дослідження залежностей інгібувальної активностісполук від їх хімічної структури, моделювання молекулярної динаміки макромолекул та їх комплексів із низькомолекулярними лігандами;
Безпосередня симуляція звертання білків методами молекулярної динаміки з енергетичною функцією, що враховує деталі взаємодій на атомному рівні, в наш час Є практично нерозв'язальною через високу вимогу до обчислювальних ресурсів.
Базові CFD розв'язувачі Нестримний потік з RANS та LES можливостями Стичкуючий потік з RANS таLES можливостями Розв'язувачі плавучих потоків DNS таLES Розв'язувачі багато фазових потоків Розв'язувачі відстеження частинок Розв'язувачі проблемзгоряння Розв'язувачі длякон'югатної теплопередачі Розв'язувачі молекулярної динаміки Розв'язувачі симулятора Монте-Карло Розв'язувачі електромагнетизму Розв'язувачі твердої динаміки.
Молекулярна динаміка, комп'ютерене моделювання.
Будучи єдиним інтегрованим застосунком воно підходить як для аналізу, так ідля візуалізації великомасштабних атомістичних наборів даних, утворених молекулярної динамікою/статикою та кодом симуляції Монте-Карло.
Моделі в молекулярній динаміці ділять простір, в якому відбувається процес, що моделюється, на клітинки.
Інтернаціональна група дослідників розрахувала молекулярну динаміку процесу, в якому кисень проходить через ряд метастабільних станів, перетворюється в озон і згодом розпадається.
Левітт був одним з перших дослідників, які застосували молекулярну динаміку до молекул ДНК і білків; він розробив перше програмне забезпечення з цією метою.
Для перевірки надійності цих методичних підходів молекулярна динаміка ряду водорозчинних глобулярних білків була розрахована із застосуванням класичних білок-валідованих силових полів.
Ключові слова: молекулярна динаміка, дифузійний рух, колективні ефекти, водні розчини аргона і гелія.
Молекулярна динаміка(у цій версії з використанням потенціалу Леннарда- Джонса): газ і рідина, конденсація і випаровування, обчислення макроскопічних величин та їх змін.
Наприклад, поєднання хімічної кінетики і механіки рідини або поєднання скінченних елементів з молекулярною динамікою.